W 2020 roku amerykańscy naukowcy dokonali przerażającego odkrycia na leżących na Morzu Południowochińskim fikcyjnych Wyspach Lingshan. Kontakt z nimi szybko się urwał, a na miejsce wkroczyła armia Korei Północnej, która chcąc przejąć całkowitą kontrolę nad owym znaleziskiem, odcięła ten obszar od reszty świata. Głównym bohaterem gry jest Nomad, czyli członek amerykańskiego oddziału specjalnego, który został tam wysłany z misją ratunkową. Choć początkowo zadaniem żołnierzy jest zbadanie sytuacji panującej na Lingshan i oswobodzenie archeologów, przedsięwzięcie szybko zmienia się w prawdziwą walkę o przetrwanie. Znaleziskiem był bowiem statek obcej cywilizacji gotowej do inwazji na Ziemię.

W Crysis Remastered akcję obserwujemy z perspektywy pierwszej osoby (FPP). Gra jest podzielona na misje, które toczą się na osobnych mapach o otwartej strukturze. Podczas zabawy mamy pełną swobodę nie tylko w kwestii wyboru drogi prowadzącej do celu, lecz również sposobów na wykonywanie stawianych przed nami zadań. Cele misji można realizować zarówno działając po cichu, jak i strzelając do wszystkiego, co nawinie nam się pod lufę.

Niezależnie od tego, którą metodę wybierzemy, sprawę ułatwia naszpikowany futurystyczną technologią nanokombinezon noszony przez protagonistę, który pozwala mu m.in. przeżyć w nieprzyjaznym środowisku (na przykład w niskiej temperaturze), a także może działać w kilku różnych trybach; mowa o chwilowej niewidzialności, przyspieszeniu ruchów oraz zwiększeniu siły i odporności na obrażenia.

Ponadto na naszym podorędziu znajduje się rozbudowany arsenał, a każdą broń możemy dostosować do indywidualnych preferencji, instalując w niej tłumik, różnorodne przyrządy optyczne oraz dodatki pokroju granatników. Wyspy eksplorujemy przy tym zarówno na piechotę, jak i korzystając z różnorodnych pojazdów oraz maszyn – oprócz samochodów terenowych możemy skorzystać między innymi z łodzi, poduszkowców oraz śmigłowców.